Sector 781 ist ein Metroidvania Plattformspiel mit einem klassischen Pixel Art Design. Es gibt 3 Reiche zu erforschen, die jeweils aus 25 Bildschirmen bestehen, die als Mini-Levels fungieren. Die Spieler müssen die Umgebung der Raumstation erkunden, um Upgrades zu sammeln, damit ihr Astronaut den Endboss des jeweiligen Bereichs finden und besiegen kann. Die Spieler können die Computerkonsolen benutzen, um ihren Fortschritt zu speichern und grüne Pips zu sammeln, um die Gesundheitsleiste des Astronauten aufzufüllen. Es gibt 6 Power-Ups zu sammeln und 7 Arten von Gegnern zu besiegen.